2005年5月，默沙东与中国卫生部签署了全面预防和治疗艾滋病的合作项目（C-MAP项目）。这一为期5年、投入高达3050万美元的项目，是迄今为止中国最大的政府与国外私营企业合作的艾滋病综合防治项目，也是中国政府探索政府与非政府机构之间、公共和私营企业之间进行合作，共同抗击艾滋病的一个重要举措。该项目首先在四川省凉山彝族自治州的3个县启动，此后扩展至四川省的其它20个地州，共计62个项目点。

2011年7月，中国－默沙东艾滋病合作项目荣获中国民政部颁发的“中华慈善奖——最具影响力慈善项目奖”，这是中国慈善领域的最高政府奖。默沙东将继续积极与中国卫生部合作，为艾滋病的全面预防和治疗贡献更大力量。

2013年10月，默沙东与中国卫生部签署“中-默艾滋病综合防治合作项目”（二期）谅解备忘录。

【默沙东·春蕾计划】

2011年11月，默沙东与中国儿童少年基金会等机构合作开展“默沙东·春蕾计划”。该计划是全国公益慈善联合行动“善行凉山”的重要组成部分。到2014年，默沙东将捐款100万美元，为四川凉山地区受艾滋病影响的青少年进行生活和就业技能培训。2014年3月，被全国妇联和中国儿童少年基金会授予2013年度“中国儿童慈善奖—突出贡献奖”。

【贝壳行动】

2013年10月10日，由妇联主办、全国心系系列活动组委会承办，默沙东中国协办的“中国女性宫颈健康促进计划”启动式暨“贝壳行动”首场健康大课堂在京举办。默沙东将在未来三年中携手全国妇联，为全国范围内1000万女性提供宣教支持。

2014年4月3日，中国女性宫颈健康促进计划—贝壳行动2014年妇女“两癌”防治论坛在京召开。该会议由中国妇女发展基金会、全国心系系列活动组委会主办，全国妇联妇女发展部支持，默沙东（中国）协办。本次活动以关爱妇女“两癌”防治为主题，分析国内外“两癌”疾病现状与发展趋势，深入了解各国HPV疫苗的普及情况，倡导“早发现、早诊断、早治疗”的健康理念，呼吁社会各界关爱妇女健康。 

【支持地震救灾工作】

默沙东一直通过自己高质量的药品、专业知识及员工志愿者项目支持亟需帮助的社区和大众。2008年汶川地震后，默沙东第一时间捐赠了药品、5辆配备先进的救护车及远程医疗系统等，总价值逾2800万元人民币，为加速救灾和重建工作提供支持。

2010年玉树地震后，默沙东向四川华西医院捐赠了总价值达22万元人民币的抗细菌感染药物，给伤员带去帮助。同时，默沙东全体员工也积极为玉树灾民捐款。

2013年雅安地震后，默沙东第一时间向华西医院及四川省人民医院捐赠了价值近16万元的灾区紧缺抗感染药品科赛斯，用于伤者救治，并将在公司内部募集的捐款总计人民币约80万元，经由上海慈善基金会转至雅安灾区。

2014年8月2日江苏苏州昆山市开发区中荣金属制品有限公司汽车轮毂抛光车间发生爆炸后，为在第一时间救治更多伤员，默沙东中国迅速决定向此次烧伤患者捐赠共计100瓶诺科飞®（通用名称：泊沙康唑口服混悬液）。 

同年8月3日，云南省昭通市鲁甸地震后，默沙东中国宣布通过云南省卫计委及红十字会捐赠2000针抗感染药物——怡万之®（通用名称：注射用厄他培南），用于赈灾救助。

【为儿童教育拓展项目】

为唤起全社会对于儿童应急教育的广泛关注，加强针对儿童的重大自然灾害应急响应教育，2010年12月默沙东携手芝麻街工作室和中国青少年发展基金共同宣布：向中国15个曾经遭遇严重自然灾害或易受灾地区的儿童及其家庭，捐赠应急知识教材。截至2012年9月，这些教材已发放至青海、甘肃、四川和广西等省的学校，约4万名儿童和家庭从中受益。

【《大鸟看世界》】

2010年12月，默沙东赞助全新芝麻街系列节目《大鸟看世界》在中国播出，把领先的学龄前教育带给中国儿童和家庭，帮助孩子们拓展科学和生活知识，鼓励他们自己动手参与探究和学习，更好地成长与发展。