PMAxx™dyeisaDNAmodifierusedforviabilityPCR,inventedbyscientistsatBiotium.PMAxx™isanewandimprovedversionofourpopularviabilitydyePMA(propidiummonoazide).LikePMA,PMAxx™isaphoto-reactivedyethatbindstodsDNAwithhighaffinity.UponphotolysiswithvisIBLelight,PMAxx™dyebecomescovalentlyattachedtodsDNA.ThePMAxx™-modifieddsDNAcannotbeamplifiedbyPCR.PMAxx™dyeisdesignedtobecellmembrane-impermeable.Thus,inapopulationofliveanddeadcells,onlydeadcellsaresusceptibletoDNAmodificationduetocompromisedcellmembranes.ThisuniquefeaturemakesPMAxx™highlyusefulinselectivedetectionoflivebacteriabyqPCR.
PMAxx™wasdesignedbyBiotiumscientiststobeasuperioralternativetoPMA.WhilePMAisgenerallyeffectiveatdifferentiatingbetweenliveanddeadbacteriabyqPCR,itdoesnotcompletelyeliminatePCRproductsfromdeadcell DNA.Thiscouldpotentiallygivefalsepositiveresults.Biotium’snewdyePMAxx™ismuchmoreeffectiveateliminatingPCRamplificationofdeadcellDNA,andthereforeprovidesthebest discriminationbetweenliveanddeadbacteria.
SinceBiotiumfirstdevelopedPMAdye,therehavebeennumerouspublicationsontheuseofthedyeinpathogenicbacterialdetectionrelatedtofoodandwatersafety,medicaldiagnosisandbiodefense(downloadthePMAReferenceList).PMAxx™shouldbecompatiblewithallexistingPMAprotocols,butwithsuperioractivity.OfcoursewealsostillselltheclassicPMAdye,inwater(40019)orlyophilizedformat(40013).
ForviabilityPCRofGram-negativebacteriawehighlyrecommendusingourPMAEnhancer(31038)inconjunctionwithPMAxx™.PMAEnhancerforGramNegativeBacteriawasdesignedtoimprovePMA-mediateddiscriminationbetweenliveanddeadGram-negativebacteria.WhenasequencefromaGram-negativebacteriaisamplifiedbyPCR,samplespre-treatedwithdyeandEnhancershowadecreaseinthesignalfromdeadcells,withnochangeinthesignalfromlivecells.PMAEnhancerisparticularlyusefulforsamplesinwhichbacteriawerekilledusingmildmethodssuchaslowheat.
Biotiumalsoprovidesstrain-specificPMAReal-TimePCRBacterialViabilitykitswithvalidatedprimersfor7selectedpathogens:M.tuberculosis,S.aureus,MRSA,Salmonella,E.coli,E.coliO157:H7andListeria.Thesekitsprovideeverythingthatyouneedfortheselectivedetectionofyourfavoritespeciesoflivebacteriabyreal-timePCR.Don’tseeyourfavoritestrain?Letusknowattechsupport@biotium.com.
Real-TimePCRBacterialViabilityKits
ForphotoactivationofPMAxx™dye(orPMAorEMA),werecommendtheuseofBiotium’sPMA-Lite™LEDPhotolysisDevice(E90002),whichisdesignedtoconductphotolysisundercontrolledconditions.
- Abs=466nm(beforephotolysis)
- Abs/Em=~510/~610nm(followingphotolysisandcovalentattachmenttoDNA/RNA)
- Darkredsolution
- Storeat-20°Candprotectfromlightatalltimes
References
PMAxxReferences
Garcia-Fontana,C.,etal.(2016)ANewPhysiologicalRolefortheDNAMoleculeasaProtectoragainstDryingStressinDesiccation-TolerantMicroorganisms.Front.Microbiol.Dec22;7:2066.
Randazzo,W.,etal.(2016)EvaluationofviabilityPCRperformanceforassessingnorovirusinfectivityinfresh-cutvegetablesandirrigationwater.Int.J.FoodMicrobiol.Jul16;229:1-6.
Randazzo,W.,etal.(2017).Improvingefficiencyofviability-qPCRforselectivedetectionofinfectiousHAVinfoodandwatersamples.JApplMicrobiol.AcceptedAuthorManuscript.doi:10.1111/jam.13519
PMAReferences
Nocker,A.,Cheung,C.Y.,andKamper,A.K.(2006).Comparisonofpropidiummonoazidewithethidiummonoazidefordifferentiationoflivevs.deadbacteriabyselectiveremovalofDNAfromdeadcells.J.MicrobioMeth.67(2),310-320.
DownloadthefullPMAReferenceList.
Biotium公司是一家在荧光技术领域独树一帜的生物技术公司,公司位于美国加利福尼亚的BAYAREA------世界上首要的生物科技中心。该公司一直致力于开发和生产用于生物医学研究的荧光指示剂及其他特殊生化产品。其产品被广泛应用于细胞生物学、蛋白质组学、分子生物学、免疫学、微生物学、诊断学、生物化学、神经科学、血液流动检测及大规模药物筛选等众多领域。Biotium公司专利产品众多,包括已经被广泛使用的实时PCR定量荧光染料EvaGreen、具有划时代意义的凝胶核酸染料GelRed和GelGreen,以及最新推出的CheetahTaq热启动酶个CF系列蛋白质标记染料等等。
GelReD®是一种超灵敏、极稳定和环境安全的荧光核酸染料,用于取代高毒性溴化乙锭(EB),用于在琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶中染色dsDNA、SSDN或RNA。GelRed®比EB敏感得多,无需拆解步骤。 1.比EB更安全:Ames试验和其他试验显示无致突变和非细胞毒性 2.易处理:通过直接排放到下水道或常规垃圾中的环境安全试验 3.超灵敏:比EtBr和SYBR®安全型更灵敏 4.非常稳定:可在水中使用,在室温下长期储存稳定,可微波 5.使用简单:非常简单的预处理或电泳后凝胶染色程序 6.与标准紫外线透照仪兼容:无需改变光学设置即可替代EtBr 7.与下游应用兼容:凝胶纯化、限制性消化、测序和克隆 GelRed和GelGreen是设计以取代剧毒的代替高毒性的溴化乙锭(EtBr)的新一代核酸凝胶荧光染料。Biotium科学家研发的GelRed和GelGreen集低毒性、高灵敏性和出色的稳定性等优点于一体,效果由于EtBr及其他EtBr替代品。 几十年来,EtBr因极其低廉的价格,一般的灵敏度,一直被用作核酸凝胶染色的主要染料。然而EtBr是一个高度诱变的物质。该染料的使用安全隐患,净化及废物处置的相关费用等,终导致其代价高昂。正因如此,近年来市场上出现了一些替代品,如SYBR系列染料等。尽管这些替代染料减少了致突变性,但却丧失了染料其他方面的功能。例如,SYBRSafe的灵敏度很低,SYBRGreen及SYBRGold的稳定性远远低于EtBr。SYBR染料能快速的进入细胞,结合线粒体及细胞核DNA,是的染料在一定浓度是有毒的。事实上,在紫外线或其他诱变剂诱导下,SYBRGreenI强烈的突变性已经被广泛认知。(Ohta,etal.MutRes492,91(2001)) 为了保证GelRed和GelGreen的安全性,Biotium的科学家采用一种新型非常简单的概念:阻止染料进入活细胞减少遗传毒性。我们相信,不给DNA结合染料渗透活细胞中结合基因组DNA的机会,便可以保证染料没有或大幅度减少其诱变性作用。因此,我们设计的GelRed和GelGreen染料拥有独特化学结构保证其无法渗透细胞膜。Ames试验验证即使浓度远远高于实验者操作凝胶染色的工作浓度,GelRed和GelGreen也无诱变性。此外,环境的安全性试验表示,GelRed和GelGreen是完全无害的,对水生生物无毒。因此,废弃的GelRed和GelGreen可以直接倒入下水道,或按照普通垃圾处理。
GelReD®和EB具有几乎相同的光谱,因此您可以直接更换EB与GeldRead®,而不改变您现有的成像系统。
凝胶红可用于琼脂糖凝胶中dsDNA、ssDNA或RNA的预染色或后染色。凝胶红还可用于聚丙烯酰胺凝胶中dsDNA、ssDNA或RNA的后凝胶染色。因此,凝胶化与下游DNA操作(如限制性消化、测序和克隆)兼容。
优势
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(1)、分子内含有发射荧光的基团,如羰基、氮氮双键、碳氮双键等。
(2)、分子内含有助色基团。助色基团使光谱红移并增大荧光效率,如伯胺基、仲胺基、羟基、醚键、酰胺基等。
(3)、分子内含有刚性平面结构的共轭π键。分子内共轭体系愈大平面性愈强其荧光强度愈高。一些能提高共轭度的因素能提高荧光效率,并使荧光波长向长波方向移动。 就是荧光染料的附着物,主要作用有帮助荧光染料展色、提高荧光染料与下游树酯的相溶性、保护荧光染料的性能。通常载体树脂是强极性树脂,分子中含有胺基、羟基、醚键、酰胺基等强极性基团,一方面有助色作用,增大荧光效率;另一方面与荧光染料有很好的相溶性,有助于染料的均匀分散。
荧光颜料常用的载体树脂有胺基树脂、苯代三聚氰胺一甲醛树脂、聚丙烯酸酯树脂、聚酰胺树酯、聚酯树脂、聚氨酯树脂等。 (1)、热塑性荧光颜料:线型
(2)、热固性荧光颜料: 体型
(3)、可溶解色精荧光颜料
(4)、水乳型荧光颜料 (1)、胺基树酯
(2)、聚酰胺树酯
(3)、聚酯树酯
(4)、丙烯酸乳液 (1)、塑胶类
低温型
中温型
高温型
(2)、涂料类
水性涂料
油性涂料
粉末涂料 (1)、含甲醛
(2)、不含甲醛
1.小鼠Lewis肺癌细胞DNA含量测定方法
(1).从C57BL/6小鼠上切除肿块,在培养皿内用PBS冲洗.
(2).去除结缔组织及脂肪,剪碎肿块.
(3).小碎片移入1.20×38mm注射针,加压使其通过,于4℃条件下重悬细胞于HBSS中.
(4).将200~300μL细胞悬液(5×105细胞/mL)中加入3mL PI(50μg/mL),染色3LL细胞,于4℃存放20~30分钟.
(5).测定580~750nm之间的发射荧光,以去除末结合PI产生的激发光与发射光谱线之间的重叠部分.
是欢快活泼的光辉色彩,是暖色系中最温暖的色,它使人联想到金色的秋天,丰硕的果实;
是一种富足、快乐而幸福的颜色。让人感觉成一种稳重、含蓄又明快的温暖;
橙色也会带来一种甜甜的感觉。
这些染料都非常成熟,光毒和淬灭都很低,当然要考虑到你采集图像时的显微镜参数。
比如calcein,常用的示踪,绿光(虽然这些颜色只是根据光谱加上去的伪彩),但要考虑你的实验过程中结合细胞结构,是否会伴随calcein的泄漏,就是荧光降低。
dri,还可以看膜啊
cfda也不错
bcef虽是ph指示,但你试验时不仅可观察细胞,还可看细胞ph变化,也行。
当然你或许还要结合其他方法,如细胞免疫化学等手段去双染或多染,都需要综合考虑染料之间特性。单独染一个染料,有点浪费,不如多染,数据和图像也好看些。现在流行细胞成像。
然后是碱性荧光染料,造纸厂用来增加纸的亮度。
直接和分散的荧光黄,印染厂用来增加棉质和化纤面料的艳度
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